XANA
À la différence de la plupart des "méchants" de fiction, XANA n'apparaît jamais en personne, n'ayant pas de corps ni même d'apparence, virtuelle ou non. En fait, cela a tendance à laisser des doutes sur sa nature : pendant toute la saison 1, il n'y a eu aucune précision claire de ce qu'était XANA, si bien que de multiples hypothèses ont été dressées par les fans. On a entre autres supposé qu'il s'agissait d'un virus ayant infecté Lyoko, ou encore, le Supercalculateur lui-même. Une confusion s'est même produite quant à savoir s'il fallait dire "il" ou "elle". Il a fallu attendre vers environ la fin de la saison 2 pour enfin avoir une description claire : XANA est en réalité un programme multi-agents qui a développé une conscience, et est ainsi devenu autonome.